Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VdrP48281 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VdrP48281 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VdrP48281 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VdrP48281 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VdrP48281 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VdrP48281 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VdrP48281 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VdrP48281 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VdrP48281 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VdrP48281 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VdrP48281 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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