Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Myo1bP46735 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myo1bP46735 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms