Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtgfrP43117 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms