Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ThpoP40226 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms