Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf1P39428 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms