Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprkP35822 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms