Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn1P35821 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn1P35821 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms