Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddit3P35639 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddit3P35639 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms