Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2aP35436 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2aP35436 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms