Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms