Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp13P33435 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp13P33435 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp13P33435 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp13P33435 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms