Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd1P33215 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd1P33215 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms