Protein–RNA interactions for Protein: P32648

Vip, VIP peptides, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VipP32648 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VipP32648 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VipP32648 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VipP32648 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VipP32648 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms