Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms