Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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