Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nckap1P28660 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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