Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa5P28312 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Defa5P28312 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms