Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa2P28309 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms