Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms