Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb1P28230 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms