Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Twist1P26687 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms