Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ChgaP26339 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms