Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms