Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms