Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms