Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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