Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms