Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klra1P20937 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klra1P20937 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms