Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TP20293 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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TP20293 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TP20293 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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TP20293 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TP20293 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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