Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NefhP19246 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NefhP19246 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NefhP19246 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms