Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms