Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18530 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18530 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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