Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcna1P16388 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcna1P16388 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms