Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rag1P15919 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rag1P15919 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rag1P15919 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms