Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Defa1P11477 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Defa1P11477 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Defa1P11477 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Defa1P11477 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Defa1P11477 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa1P11477 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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