Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms