Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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