Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms