Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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