Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prm2P07978 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms