Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms