Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01823 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01823 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01823 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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