Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01788 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01788 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01788 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01788 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01788 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01788 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01788 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01788 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01788 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms