Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01748 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01748 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01748 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms