Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01644 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01644 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01644 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01644 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01644 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01644 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01644 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01644 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01644 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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