Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms