Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl2O89104 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms