Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnkO88874 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnkO88874 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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