Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BlmO88700 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BlmO88700 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BlmO88700 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms