Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc6a20bO88575 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a20bO88575 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a20bO88575 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Slc6a20bO88575 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms